Um bestimmte Artikel lediglich am POS verkaufen zu können, ohne diese auch in deinem Onlineshop anbieten zu müssen, dürfen diese Artikel nicht in deinem Hauptshop verfügbar sein. Entferne dafür einfach im Tab Kategorien in den Artikelstammdaten die Hauptshop-Kategorie im Bereich Zugewiesene Kategorien. Es ist auch unproblematisch, wenn dem Artikel gar keine Kategorie mehr zugewiesen ist, da der Artikel dennoch über die POS App zum Kauf zur Verfügung steht. Kategorien lassen sich unter Artikel → Kategorien erstellen und bearbeiten.
Alternativ kannst du den Artikel auch deaktivieren, indem du in den Stammdaten des Artikels den Haken bei Artikel aktiv entfernst. In der POS App wird dir dieser Artikel dann zwar als deaktiviert angezeigt, kann aber wie gewohnt verkauft werden.